Постановлением Правительства Российской Федерации от 12.11.2010 № 890 были утверждены изменения в ФЦП «Обеспечение ядерной и радиационной безопасности на 2008 год и на период до 2015 года».

В 2010 году Госкорпорация «Росатом», по согласованию с заинтересованными федеральными органами исполнительной власти, разработала предложения по внесению в Программу изменений, обусловленных:
 упразднением Федерального агентства по науке и инновациям и Федерального агентства по образованию с передачей функций упраздненных Агентств Министерству образования и науки Российской Федерации (указ Президента Российской Федерации от 4.03.2010 № 241);
 передачей в ведение Госкорпорации «Росатом» федерального государственного унитарного предприятия «Ордена Трудового Красного Знамени научно-исследовательского физико-химического института имени Л.Я. Карпова» (указ Президента Российской Федерации от 3.09.2009 № 1007);
 необходимостью концентрации финансовых и организационных ресурсов на решение ключевых задач обеспечения ядерной и радиационной безопасности при обращении с отработавшим ядерным топливом и радиоактивными отходами и выводе из эксплуатации ядерно и радиационно опасных объектов.
Объем финансирования в целом по Программе не изменился.